KCNJ5

Ідентифікатори

Символи

KCNJ5, CIR, GIRK4, KATP1, KIR3.4, LQT13, potassium voltage-gated channel subfamily J member 5, potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 5

Зовнішні ІД

OMIM: 600734 MGI: 104755 HomoloGene: 20248 GeneCards: KCNJ5

Пов'язані генетичні захворювання

long QT syndrome 13^[1]

Реагує на сполуку

sodium ion^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• G-protein activated inward rectifier potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • inward rectifier potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity • voltage-gated potassium channel activity involved in atrial cardiac muscle cell action potential repolarization • voltage-gated potassium channel activity involved in ventricular cardiac muscle cell action potential repolarization
Клітинна компонента	• integral component of membrane • T-tubule • клітинна мембрана • мембрана • external side of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex
Біологічний процес	• potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • regulation of heart rate by cardiac conduction • membrane repolarization during atrial cardiac muscle cell action potential • membrane repolarization during ventricular cardiac muscle cell action potential • ventricular cardiac muscle cell membrane repolarization • potassium ion import across plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3762


16521

Ensembl


ENSG00000120457


ENSMUSG00000032034

UniProt


P48544


P48545

RefSeq (мРНК)


NM_000890 NM_001354169


NM_010605

RefSeq (білок)


NP_000881 NP_001341098


NP_034735

Локус (UCSC)

Хр. 11: 128.89 – 128.92 Mb

Хр. 9: 32.23 – 32.26 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNJ5 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily J member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 47 668^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGDSRNAMN	QDMEIGVTPW	DPKKIPKQAR	DYVPIATDRT	RLLAEGKKPR
QRYMEKSGKC	NVHHGNVQET	YRYLSDLFTT	LVDLKWRFNL	LVFTMVYTVT
WLFFGFIWWL	IAYIRGDLDH	VGDQEWIPCV	ENLSGFVSAF	LFSIETETTI
GYGFRVITEK	CPEGIILLLV	QAILGSIVNA	FMVGCMFVKI	SQPKKRAETL
MFSNNAVISM	RDEKLCLMFR	VGDLRNSHIV	EASIRAKLIK	SRQTKEGEFI
PLNQTDINVG	FDTGDDRLFL	VSPLIISHEI	NQKSPFWEMS	QAQLHQEEFE
VVVILEGMVE	ATGMTCQARS	SYMDTEVLWG	HRFTPVLTLE	KGFYEVDYNT
FHDTYETNTP	SCCAKELAEM	KREGRLLQYL	PSPPLLGGCA	EAGLDAEAEQ
NEEDEPKGLG	GSREARGSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у мембрані.

Література

Ashford M.L.J., Bond C.T., Blair T.A., Adelman J.P. (1994). Cloning and functional expression of a rat heart KATP channel. Nature. 370: 456—459. PMID 8047164 DOI:10.1038/370456a0
Ashford M.L.J., Bond C.T., Blair T.A., Adelman J.P. (1995). Nature. 378: 792—792. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8524415 DOI:10.1038/378792a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Oki K., Plonczynski M.W., Luis Lam M., Gomez-Sanchez E.P., Gomez-Sanchez C.E. (2012). Potassium channel mutant KCNJ5 T158A expression in HAC-15 cells increases aldosterone synthesis. Endocrinology. 153: 1774—1782. PMID 22315453 DOI:10.1210/en.2011-1733

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCNJ5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6266 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, P48544 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані