KCND2

Ідентифікатори

Символи

KCND2, KV4.2, RK5, potassium voltage-gated channel subfamily D member 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605410 MGI: 102663 HomoloGene: 40828 GeneCards: KCND2

Пов'язані генетичні захворювання

токсикоманія^[1]

Реагує на сполуку

Гуанідин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• potassium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • A-type (transient outward) potassium channel activity • voltage-gated potassium channel activity • voltage-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
Клітинна компонента	• integral component of membrane • перикаріон • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • plasma membrane raft • intrinsic component of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • dendritic spine • синапс • integral component of plasma membrane • neuronal cell body membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • glutamatergic synapse • GABA-ergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
Біологічний процес	• chemical synaptic transmission • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • трансмембранний транспорт • potassium ion transmembrane transport • потенціал дії • sensory perception of pain • protein homooligomerization • cellular response to hypoxia • neuronal action potential • locomotor rhythm • regulation of postsynaptic membrane potential • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3751


16508

Ensembl


ENSG00000184408


ENSMUSG00000060882

UniProt


Q9NZV8


Q9Z0V2

RefSeq (мРНК)


NM_012281


NM_019697

RefSeq (білок)


NP_036413


NP_062671

Локус (UCSC)

Хр. 7: 120.27 – 120.75 Mb

Хр. 6: 21.22 – 21.73 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCND2 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily D member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 630 амінокислот, а молекулярна маса — 70 537^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGVAAWLP	FARAAAIGWM	PVASGPMPAP	PRQERKRTQD	ALIVLNVSGT
RFQTWQDTLE	RYPDTLLGSS	ERDFFYHPET	QQYFFDRDPD	IFRHILNFYR
TGKLHYPRHE	CISAYDEELA	FFGLIPEIIG	DCCYEEYKDR	RRENAERLQD
DADTDTAGES	ALPTMTARQR	VWRAFENPHT	STMALVFYYV	TGFFIAVSVI
ANVVETVPCG	SSPGHIKELP	CGERYAVAFF	CLDTACVMIF	TVEYLLRLAA
APSRYRFVRS	VMSIIDVVAI	LPYYIGLVMT	DNEDVSGAFV	TLRVFRVFRI
FKFSRHSQGL	RILGYTLKSC	ASELGFLLFS	LTMAIIIFAT	VMFYAEKGSS
ASKFTSIPAA	FWYTIVTMTT	LGYGDMVPKT	IAGKIFGSIC	SLSGVLVIAL
PVPVIVSNFS	RIYHQNQRAD	KRRAQKKARL	ARIRAAKSGS	ANAYMQSKRN
GLLSNQLQSS	EDEQAFVSKS	GSSFETQHHH	LLHCLEKTTN	HEFVDEQVFE
ESCMEVATVN	RPSSHSPSLS	SQQGVTSTCC	SRRHKKTFRI	PNANVSGSHQ
GSIQELSTIQ	IRCVERTPLS	NSRSSLNAKM	EECVKLNCEQ	PYVTTAIISI
PTPPVTTPEG	DDRPESPEYS	GGNIVRVSAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Baehring R., Boland L.M., Varghese A., Gebauer M., Pongs O. (2001). Kinetic analysis of open- and closed-state inactivation transitions in human Kv4.2 A-type potassium channels. J. Physiol. (Lond.). 535: 65—81. PMID 11507158 DOI:10.1111/j.1469-7793.2001.00065.x
Bertaso F., Sharpe C.C., Hendry B.M., James A.F. (2002). Expression of voltage-gated K+ channels in human atrium. Basic Res. Cardiol. 97: 424—433. PMID 12395204 DOI:10.1007/s00395-002-0377-4
Jerng H.H., Qian Y., Pfaffinger P.J. (2004). Modulation of Kv4.2 channel expression and gating by dipeptidyl peptidase 10 (DPP10). Biophys. J. 87: 2380—2396. PMID 15454437 DOI:10.1529/biophysj.104.042358
Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
Baranauskas G. (2007). Ionic channel function in action potential generation: current perspective. Mol. Neurobiol. 35: 129—150. PMID 17917103 DOI:10.1007/s12035-007-8001-0

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KCND2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium voltage-gated channel subfamily D member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6238 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZV8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані