NFATC1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A66, 1NFA

Ідентифікатори

Символи

NFATC1, NF-ATC, NFAT2, NFATc, NF-ATc1.2, nuclear factor of activated T-cells 1, nuclear factor of activated T cells 1

Зовнішні ІД

OMIM: 600489 MGI: 102469 HomoloGene: 32336 GeneCards: NFATC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • mitogen-activated protein kinase p38 binding • FK506 binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • transcription factor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • calcineurin-NFAT signaling cascade • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • negative regulation of Wnt signaling pathway • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation • GO:0032617 cytokine production • aortic valve morphogenesis • pulmonary valve morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4772


18018

Ensembl


ENSG00000131196


ENSMUSG00000033016

UniProt


O95644


O88942

RefSeq (мРНК)

NM_172390 NM_001278669 NM_001278670 NM_001278672 NM_001278673
NM_001278675 NM_006162 NM_172387 NM_172388 NM_172389

NM_001164109 NM_001164110 NM_001164111 NM_001164112 NM_016791
NM_198429

RefSeq (білок)

NP_001265598 NP_001265599 NP_001265601 NP_001265602 NP_001265604
NP_006153 NP_765975 NP_765976 NP_765977 NP_765978


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 18: 79.4 – 79.53 Mb

Хр. 18: 80.65 – 80.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFATC1 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 101 243^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSTSFPVPS	KFPLGPAAAV	FGRGETLGPA	PRAGGTMKSA	EEEHYGYASS
NVSPALPLPT	AHSTLPAPCH	NLQTSTPGII	PPADHPSGYG	AALDGGPAGY
FLSSGHTRPD	GAPALESPRI	EITSCLGLYH	NNNQFFHDVE	VEDVLPSSKR
SPSTATLSLP	SLEAYRDPSC	LSPASSLSSR	SCNSEASSYE	SNYSYPYASP
QTSPWQSPCV	SPKTTDPEEG	FPRGLGACTL	LGSPRHSPST	SPRASVTEES
WLGARSSRPA	SPCNKRKYSL	NGRQPPYSPH	HSPTPSPHGS	PRVSVTDDSW
LGNTTQYTSS	AIVAAINALT	TDSSLDLGDG	VPVKSRKTTL	EQPPSVALKV
EPVGEDLGSP	PPPADFAPED	YSSFQHIRKG	GFCDQYLAVP	QHPYQWAKPK
PLSPTSYMSP	TLPALDWQLP	SHSGPYELRI	EVQPKSHHRA	HYETEGSRGA
VKASAGGHPI	VQLHGYLENE	PLMLQLFIGT	ADDRLLRPHA	FYQVHRITGK
TVSTTSHEAI	LSNTKVLEIP	LLPENSMRAV	IDCAGILKLR	NSDIELRKGE
TDIGRKNTRV	RLVFRVHVPQ	PSGRTLSLQV	ASNPIECSQR	SAQELPLVEK
QSTDSYPVVG	GKKMVLSGHN	FLQDSKVIFV	EKAPDGHHVW	EMEAKTDRDL
CKPNSLVVEI	PPFRNQRITS	PVHVSFYVCN	GKRKRSQYQR	FTYLPANVPI
IKTEPTDDYE	PAPTCGPVSQ	GLSPLPRPYY	SQQLAMPPDP	SSCLVAGFPP
CPQRSTLMPA	APGVSPKLHD	LSPAAYTKGV	ASPGHCHLGL	PQPAGEAPAV
QDVPRPVATH	PGSPGQPPPA	LLPQQVSAPP	SSSCPPGLEH	SLCPSSPSPP
LPPATQEPTC	LQPCSPACPP	ATGRPQHLPS	TVRRDESPTA	GPRLLPEVHE
DGSPNLAPIP	VTVKREPEEL	DQLYLDDVNE	IIRNDLSSTS	THS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Park J., Takeuchi A., Sharma S. (1996). Characterization of a new isoform of the NFAT (nuclear factor of activated T cells) gene family member NFATc. J. Biol. Chem. 271: 20914—20921. PMID 8702849 DOI:10.1074/jbc.271.34.20914
Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics. 92: 279—291. PMID 18675896 DOI:10.1016/j.ygeno.2008.06.011
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lyakh L., Ghosh P., Rice N.R. (1997). Expression of NFAT-family proteins in normal human T cells. Mol. Cell. Biol. 17: 2475—2484. PMID 9111316 DOI:10.1128/MCB.17.5.2475
Beals C.R., Sheridan C.M., Turck C.W., Gardner P., Crabtree G.R. (1997). Nuclear export of NF-ATc enhanced by glycogen synthase kinase-3. Science. 275: 1930—1934. PMID 9072970 DOI:10.1126/science.275.5308.1930
Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell. 96: 611—614. PMID 10089876 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80571-1

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7775 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O95644 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма