HIVEP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BBO, 4ZNF

Ідентифікатори

Символи

HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, HIVEP zinc finger 1

Зовнішні ІД

OMIM: 194540 MGI: 96100 HomoloGene: 1596 GeneCards: HIVEP1

Пов'язані генетичні захворювання

токсикоманія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • BMP signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3096


110521

Ensembl


ENSG00000095951


ENSMUSG00000021366

UniProt


P15822


Q03172

RefSeq (мРНК)


NM_002114


NM_007772

RefSeq (білок)


NP_002105


NP_031798

Локус (UCSC)

Хр. 6: 12.01 – 12.16 Mb

Хр. 13: 42.21 – 42.35 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIVEP1 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 718 амінокислот, а молекулярна маса — 296 865^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRTKQIHPR	NLRDKIEEAQ	KELNGAEVSK	KEILQAGVKG	TSESLKGVKR
KKIVAENHLK	KIPKSPLRNP	LQAKHKQNTE	ESSFAVLHSA	SESHKKQNYI
PVKNGKQFTK	QNGETPGIIA	EASKSEESVS	PKKPLFLQQP	SELRRWRSEG
ADPAKFSDLD	EQCDSSSLSS	KTRTDNSECI	SSHCGTTSPS	YTNTAFDVLL
KAMEPELSTL	SQKGSPCAIK	TEKLRPNKTA	RSPPKLKNSS	MDAPNQTSQE
LVAESQSSCT	SYTVHMSAAQ	KNEQGAMQSA	SHLYHQHEHF	VPKSNQHNQQ
LPGCSGFTGS	LTNLQNQENA	KLEQVYNIAV	TSSVGLTSPS	SRSQVTPQNQ
QMDSASPLSI	SPANSTQSPP	MPIYNSTHVA	SVVNQSVEQM	CNLLLKDQKP
KKQGKYICEY	CNRACAKPSV	LLKHIRSHTG	ERPYPCVTCG	FSFKTKSNLY
KHKKSHAHTI	KLGLVLQPDA	GGLFLSHESP	KALSIHSDVE	DSGESEEEGA
TDERQHDLGA	MELQPVHIIK	RMSNAETLLK	SSFTPSSPEN	VIGDFLLQDR
SAESQAVTEL	PKVVVHHVTV	SPLRTDSPKA	MDPKPELSSA	QKQKDLQVTN
VQPLSANMSQ	GGVSRLETNE	NSHQKGDMNP	LEGKQDSHVG	TVHAQLQRQQ
ATDYSQEQQG	KLLSPRSLGS	TDSGYFSRSE	SADQTVSPPT	PFARRLPSTE
QDSGRSNGPS	AALVTTSTPS	ALPTGEKALL	LPGQMRPPLA	TKTLEERISK
LISDNEALVD	DKQLDSVKPR	RTSLSRRGSI	DSPKSYIFKD	SFQFDLKPVG
RRTSSSSDIP	KSPFTPTEKS	KQVFLLSVPS	LDCLPITRSN	SMPTTGYSAV
PANIIPPPHP	LRGSQSFDDK	IGTFYDDVFV	SGPNAPVPQS	GHPRTLVRQA
AIEDSSANES	HVLGTGQSLD	ESHQGCHAAG	EAMSVRSKAL	AQGPHIEKKK
SHQGRGTMFE	CETCRNRYRK	LENFENHKKF	YCSELHGPKT	KVAMREPEHS
PVPGGLQPQI	LHYRVAGSSG	IWEQTPQIRK	RRKMKSVGDD	EELQQNESGT
SPKSSEGLQF	QNALGCNPSL	PKHNVTIRSD	QQHKNIQLQN	SHIHLVARGP
EQTMDPKLST	IMEQQISSAA	QDKIELQRHG	TGISVIQHTN	SLSRPNSFDK
PEPFERASPV	SFQELNRTGK	SGSLKVIGIS	QEESHPSRDG	SHPHQLALSD
ALRGELQESS	RKSPSERHVL	GQPSRLVRQH	NIQVPEILVT	EEPDRDLEAQ
CHDQEKSEKF	SWPQRSETLS	KLPTEKLPPK	KKRLRLAEIE	HSSTESSFDS
TLSRSLSRES	SLSHTSSFSA	SLDIEDVSKT	EASPKIDFLN	KAEFLMIPAG
LNTLNVPGCH	REMRRTASEQ	INCTQTSMEV	SDLRSKSFDC	GSITPPQTTP
LTELQPPSSP	SRVGVTGHVP	LLERRRGPLV	RQISLNIAPD	SHLSPVHPTS
FQNTALPSVN	AVPYQGPQLT	STSLAEFSAN	TLHSQTQVKD	LQAETSNSSS
TNVFPVQQLC	DINLLNQIHA	PPSHQSTQLS	LQVSTQGSKP	DKNSVLSGSS
KSEDCFAPKY	QLHCQVFTSG	PSCSSNPVHS	LPNQVISDPV	GTDHCVTSAT
LPTKLIDSMS	NSHPLLPPEL	RPLGSQVQKV	PSSFMLPIRL	QSSVPAYCFA
TLTSLPQILV	TQDLPNQPIC	QTNHSVVPIS	EEQNSVPTLQ	KGHQNALPNP
EKEFLCENVF	SEMSQNSSLS	ESLPITQKIS	VGRLSPQQES	SASSKRMLSP
ANSLDIAMEK	HQKRAKDENG	AVCATDVRPL	EALSSRVNEA	SKQKKPILVR
QVCTTEPLDG	VMLEKDVFSQ	PEISNEAVNL	TNVLPADNSS	TGCSKFVVIE
PISELQEFEN	IKSSTSLTLT	VRSSPAPSEN	THISPLKCTD	NNQERKSPGV
KNQGDKVNIQ	EQSQQPVTSL	SLFNIKDTQQ	LAFPSLKTTT	NFTWCYLLRQ
KSLHLPQKDQ	KTSAYTDWTV	SASNPNPLGL	PTKVALALLN	SKQNTGKSLY
CQAITTHSKS	DLLVYSSKWK	SSLSKRALGN	QKSTVVEFSN	KDASEINSEQ
DKENSLIKSE	PRRIKIFDGG	YKSNEEYVYV	RGRGRGKYIC	EECGIRCKKP
SMLKKHIRTH	TDVRPYHCTY	CNFSFKTKGN	LTKHMKSKAH	SKKCVDLGVS
VGLIDEQDTE	ESDEKQRFSY	ERSGYDLEES	DGPDEDDNEN	EDDDEDSQAE
SVLSATPSVT	ASPQHLPSRS	SLQDPVSTDE	DVRITDCFSG	VHTDPMDVLP
RALLTRMTVL	STAQSDYNRK	TLSPGKARQR	AARDENDTIP	SVDTSRSPCH
QMSVDYPESE	EILRSSMAGK	AVAITQSPSS	VRLPPAAAEH	SPQTAAGMPS
VASPHPDPQE	QKQQITLQPT	PGLPSPHTHL	FSHLPLHSQQ	QSRTPYNMVP
VGGIHVVPAG	LTYSTFVPLQ	AGPVQLTIPA	VSVVHRTLGT	HRNTVTEVSG
TTNPAGVAEL	SSVVPCIPIG	QIRVPGLQNL	STPGLQSLPS	LSMETVNIVG
LANTNMAPQV	HPPGLALNAV	GLQVLTANPS	SQSSPAPQAH	IPGLQILNIA
LPTLIPSVSQ	VAVDAQGAPE	MPASQSKACE	TQPKQTSVAS	ANQVSRTESP
QGLPTVQREN	AKKVLNPPAP	AGDHARLDGL	SKMDTEKAAS	ANHVKPKPEL
TSIQGQPAST	SQPLLKAHSE	VFTKPSGQQT	LSPDRQVPRP	TALPRRQPTV
HFSDVSSDDD	EDRLVIAT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Fan C.M., Maniatis T. (1990). A DNA-binding protein containing two widely separated zinc finger motifs that recognize the same DNA sequence. Genes Dev. 4: 29—42. PMID 2106471 DOI:10.1101/gad.4.1.29
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Baldwin A.S. Jr., LeClair K.P., Singh H., Sharp P.A. (1990). A large protein containing zinc finger domains binds to related sequence elements in the enhancers of the class I major histocompatibility complex and kappa immunoglobulin genes. Mol. Cell. Biol. 10: 1406—1414. PMID 2108316 DOI:10.1128/MCB.10.4.1406
Lallemand C., Palmieri M., Blanchard B., Meritet J.F., Tovey M.G. (2002). GAAP-1: a transcriptional activator of p53 and IRF-1 possesses pro-apoptotic activity. EMBO Rep. 3: 153—158. PMID 11818340 DOI:10.1093/embo-reports/kvf032
Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
Omichinski J.G., Clore G.M., Appella E., Sakaguchi K., Gronenborn A.M. (1990). High-resolution three-dimensional structure of a single zinc finger from a human enhancer binding protein in solution. Biochemistry. 29: 9324—9334. PMID 2248949 DOI:10.1021/bi00492a004

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HIVEP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4920 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P15822 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма