HLA-DRB5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FV1, 1H15, 1HQR, 1ZGL

Ідентифікатори

Символи

HLA-DRB5, HLA-DRB, major histocompatibility complex, class II, DR beta 5, HLA-DRB5*

Зовнішні ІД

OMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 GeneCards: HLA-DRB5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • екзосома
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • T cell costimulation • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3127


14969

Ensembl


ENSG00000198502


ENSMUSG00000060586

UniProt


Q30154

P04231 P04230 P18468 P18469 O78196
н/д

RefSeq (мРНК)


NM_002125


NM_010382

RefSeq (білок)


NP_002116


NP_034512

Локус (UCSC)

Хр. 6: 32.52 – 32.53 Mb

Хр. 17: 34.52 – 34.54 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DRB5 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DR beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 30 056^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCLKLPGGS	YMAKLTVTLM	VLSSPLALAG	DTRPRFLQQD	KYECHFFNGT
ERVRFLHRDI	YNQEEDLRFD	SDVGEYRAVT	ELGRPDAEYW	NSQKDFLEDR
RAAVDTYCRH	NYGVGESFTV	QRRVEPKVTV	YPARTQTLQH	HNLLVCSVNG
FYPGSIEVRW	FRNSQEEKAG	VVSTGLIQNG	DWTFQTLVML	ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT	SPLTVEWRAQ	SESAQSKMLS	GVGGFVLGLL	FLGAGLFIYF
KNQKGHSGLH	PTGLVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Wu S., Saunders T.L., Bach F.H. (1986). Polymorphism of human Ia antigens generated by reciprocal intergenic exchange between two DR beta loci. Nature. 324: 676—679. PMID 3099214 DOI:10.1038/324676a0
Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic. Immunogenetics. 27: 449—455. PMID 3259543 DOI:10.1007/BF00364432
Demopulos J.T., Hodge T.W., Wooten V., Acton R.T. (1991). A novel DRB1 allele in DR2-positive American blacks. Hum. Immunol. 30: 41—44. PMID 2001975 DOI:10.1016/0198-8859(91)90069-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591—4595. PMID 2885840 DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
Kervaire B., Tiercy J. (1997). Sequence of a new HLA-DR allele, DRB5*0106. Eur. J. Immunogenet. 24: 225—228. PMID 9226128 DOI:10.1111/j.1365-2370.1997.00267.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4953 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q30154 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 6 вересня 2017.