EAF2

Ідентифікатори

Символи

EAF2, BM040, TRAITS, U19, ELL associated factor 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607659 MGI: 2146616 HomoloGene: 10208 GeneCards: EAF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• nuclear speck • transcription elongation factor complex • super elongation complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cell growth • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • transcription by RNA polymerase II • transcription elongation from RNA polymerase II promoter
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55840


106389

Ensembl


ENSG00000145088


ENSMUSG00000022838

UniProt


Q96CJ1


Q91ZD6

RefSeq (мРНК)


NM_018456 NM_001320041


NM_001113401 NM_001113405 NM_134111 NM_001358102

RefSeq (білок)


NP_001306970 NP_060926


NP_001106872 NP_001106876 NP_598872 NP_001345031

Локус (UCSC)

Хр. 3: 121.84 – 121.89 Mb

Хр. 16: 36.61 – 36.7 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

EAF2 (англ. ELL associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 28 792^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSAAGFSHL	DRRERVLKLG	ESFEKQPRCA	FHTVRYDFKP	ASIDTSSEGY
LEVGEGEQVT	ITLPNIEGST	PPVTVFKGSK	KPYLKECILI	INHDTGECRL
EKLSSNITVK	KTRVEGSSKI	QYRKEQQQQQ	MWNSARTPNL	VKHSPSEDKM
SPASPIDDIE	RELKAEASLM	DQMSSCDSSS	DSKSSSSSSS	EDSSSDSEDE
DCKSSTSDTG	NCVSGHPTMT	QYRIPDIDAS	HNRFRDNSGL	LMNTLRNDLQ
LSESGSDSDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Simone F., Luo R.T., Polak P.E., Kaberlein J.J., Thirman M.J. (2003). ELL-associated factor 2 (EAF2), a functional homolog of EAF1 with alternative ELL binding properties. Blood. 101: 2355—2362. PMID 12446457 DOI:10.1182/blood-2002-06-1664
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kong S.E., Banks C.A., Shilatifard A., Conaway J.W., Conaway R.C. (2005). ELL-associated factors 1 and 2 are positive regulators of RNA polymerase II elongation factor ELL. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 10094—10098. PMID 16006523 DOI:10.1073/pnas.0503017102

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23115 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96CJ1 (англ.) . Архів оригіналу за 30 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.