CALY

Ідентифікатори

Символи

CALY, DRD1IP, NSG3, calcyon neuron specific vesicular protein

Зовнішні ІД

OMIM: 604647 MGI: 1915816 HomoloGene: 9256 GeneCards: CALY

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • clathrin light chain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • cargo receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • мембрана • ендосома • postsynaptic endocytic zone • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• clathrin coat assembly • dopamine receptor signaling pathway • positive regulation of endocytosis • ендоцитоз • endosomal transport • postsynaptic neurotransmitter receptor internalization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


50632


68566

Ensembl


ENSG00000130643


ENSMUSG00000025468

UniProt


Q9NYX4


Q9DCA7

RefSeq (мРНК)


NM_015722 NM_001321617


NM_001190385 NM_001190386 NM_026769

RefSeq (білок)


NP_001308546 NP_056537


NP_001177314 NP_001177315 NP_081045

Локус (UCSC)

Хр. 10: 133.32 – 133.34 Mb

Хр. 7: 139.65 – 139.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CALY (англ. Calcyon neuron specific vesicular protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 23 434^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVKLGCSFSG	KPGKDPGDQD	GAAMDSVPLI	SPLDISQLQP	PLPDQVVIKT
QTEYQLSSPD	QQNFPDLEGQ	RLNCSHPEEG	RRLPTARMIA	FAMALLGCVL
IMYKAIWYDQ	FTCPDGFLLR	HKICTPLTLE	MYYTEMDPER	HRSILAAIGA
YPLSRKHGTE	TPAAWGDGYR	AAKEERKGPT	QAGAAAAATE	PPGKPSAKAE
KEAARKAAGS	AAPPPAQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах.

Література

Lezcano N., Mrzljak L., Levenson R., Bergson C. (2006). Science. 314: 1681—1681. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 17170272 DOI:10.1126/science.314.5806.1681b
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Koh P.O., Bergson C., Undie A.S., Goldman-Rakic P.S., Lidow M.S. (2003). Up-regulation of the D1 dopamine receptor-interacting protein, calcyon, in patients with schizophrenia. Arch. Gen. Psychiatry. 60: 311—319. PMID 12622665 DOI:10.1001/archpsyc.60.3.311
Ali M.K., Bergson C. (2003). Elevated intracellular calcium triggers recruitment of the receptor cross-talk accessory protein calcyon to the plasma membrane. J. Biol. Chem. 278: 51654—51663. PMID 14534309 DOI:10.1074/jbc.M305803200
Xiao J., Dai R., Negyessy L., Bergson C. (2006). Calcyon, a novel partner of clathrin light chain, stimulates clathrin-mediated endocytosis. J. Biol. Chem. 281: 15182—15193. PMID 16595675 DOI:10.1074/jbc.M600265200
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17938 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NYX4 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.