Каспаза 9

Каспаза 9
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

4RHW, 1JXQ, 1NW9, 2AR9, 3D9T, 3V3K, 3YGS

Идентификаторы
ПсевдонимыCASP9, APAF-3, APAF3, ICE-LAP6, MCH6, PPP1R56, caspase 9
Внешние IDOMIM: 602234 MGI: 1277950 HomoloGene: 31024 GeneCards: CASP9
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме CASP9
Расположение в геноме CASP9
Локус1p36.21Начало15,490,832 bp[1]
Конец15,526,534 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
4-я хромосома мыши
Хр.4-я хромосома мыши[2]
4-я хромосома мыши
Расположение в геноме CASP9
Расположение в геноме CASP9
Локус4|4 D3Начало141,520,923 bp[2]
Конец141,543,287 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right uterine tube

  • secondary oocyte

  • right testis

  • apex of heart

  • left testis

  • left lobe of thyroid gland
Наибольшая экспрессия в
  • medullary collecting duct

  • cumulus cell

  • Region I of hippocampus proper

  • saccule

  • superior surface of tongue

  • lumbar spinal ganglion
Дополнительные справочные данные
BioGPS


Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • cysteine-type peptidase activity
  • SH3 domain binding
  • peptidase activity
  • связывание с белками плазмы
  • enzyme activator activity
  • гидролазная активность
  • protein kinase binding
  • cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis
  • cysteine-type endopeptidase activity
  • связывание похожих белков
  • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway
  • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • цитозоль
  • митохондрия
  • апоптосома
  • клеточное ядро
  • protein-containing complex
Биологический процесс
  • regulation of apoptotic process
  • response to estradiol
  • response to organic cyclic compound
  • signal transduction in response to DNA damage
  • cellular response to UV
  • response to antibiotic
  • cellular response to organic cyclic compound
  • старение человека
  • Тромбопоэз
  • glial cell apoptotic process
  • cellular response to dexamethasone stimulus
  • протеолиз
  • cellular response to DNA damage stimulus
  • response to lipopolysaccharide
  • positive regulation of neuron apoptotic process
  • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c
  • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
  • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
  • regulation of response to DNA damage stimulus
  • response to cobalt ion
  • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
  • response to UV
  • execution phase of apoptosis
  • positive regulation of apoptotic process
  • апоптоз
  • нефрогенез
  • response to ischemia
  • leukocyte apoptotic process
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

842

12371

Ensembl

ENSG00000132906

ENSMUSG00000028914

UniProt

P55211

Q8C3Q9

RefSeq (мРНК)

NM_001229
NM_001278054
NM_032996

NM_001277932
NM_015733
NM_001355176

RefSeq (белок)

NP_001220
NP_001264983
NP_127463

NP_001264861
NP_056548
NP_001342105

Локус (UCSC)Chr 1: 15.49 – 15.53 MbChr 4: 141.52 – 141.54 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Каспаза 9 (англ. Caspase 9, сокр. CASP9) — протеолитический фермент (КФ 3.4.22.62), одна из каспаз человека, кодируемая одноимённым геномCASP9, который локализован на коротком плече (p-плече) 1-й хромосоме. Является инициаторной каспазой[5]. Каспаза 9 играет важную роль в сигнальной цепочке апоптоза, вероятно, представляя наиболее «верхний» узел протеазного каскада этой цепочки после сборки апоптосомы[6]. После активации апоптосомой каспаза 9 в свою очередь активирует ряд других молекул, что в конечном счёте и вызывает запрограммированную клеточную смерть. Такая способность позволила использовать её в генной инженерии в качестве индуцируемого малой молекулой "предохранителя" для самоликвидации ИПСК в случае необходимости[7].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000132906 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028914 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Caspase 9  (неопр.). Дата обращения: 20 ноября 2023. Архивировано 11 марта 2010 года.
  6. Li, P.; Nijhawan, D.; Budihardjo, I.; Srinivasula, S. M.; Ahmad, M.; Alnemri, E. S.; Wang, X. : Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade. Cell 91: 479—489, 1997. PMID 9390557
  7. Miki Ando, Toshinobu Nishimura, Satoshi Yamazaki,et al., & Hiromitsu Nakauchi (2015). A Safeguard System for Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Rejuvenated T Cell Therapy. Stem Cell Reports. DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.stemcr.2015.07.011
Перейти к шаблону «Цистеиновые протеазы»
Кальпаин
  • CAPN1
  • CAPN2
  • CAPN3
  • CAPN5
  • CAPN6
  • CAPN7
  • CAPN8
  • CAPN9
  • CAPN10
  • CAPN11
  • CAPN12
  • CAPN13
  • CAPN14
  • CAPNS1
  • CAPNS2
Каспазы
Катепсин
Полученные из растений
(плодов)
Остальные
  • Клострипаин
  • Аутофагин