Protéine ATM

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ATM
Identifiants
AliasesATM
IDs externesOMIM: 607585 MGI: 107202 HomoloGene: 30952 GeneCards: ATM
Position du gène (Homme)
Chromosome 11 humain
Chr.Chromosome 11 humain[1]
Chromosome 11 humain
Localisation génomique pour ATM
Localisation génomique pour ATM
Locus11q22.3Début108,223,044 bp[1]
Fin108,369,102 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 9 (souris)
Chr.Chromosome 9 (souris)[2]
Chromosome 9 (souris)
Localisation génomique pour ATM
Localisation génomique pour ATM
Locus9 A5.3|9 29.12 cMDébut53,350,449 bp[2]
Fin53,448,040 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • tendon calcanéen

  • epithelium of colon

  • corps calleux

  • ganglion lymphatique

  • cellule de la moelle osseuse

  • body of pancreas

  • nerf sural

  • tonsille

  • artère temporale superficielle

  • ventricular zone
Fortement exprimé dans
  • parotide

  • tail of embryo

  • glande lacrymale

  • ventricular zone

  • morula

  • Épiblaste

  • maxillary prominence

  • canal déférent

  • éminence ganglionnaire

  • epithelium of stomach
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • activité de transférase
  • liaison ADN
  • liaison nucléotide
  • protein kinase activity
  • DNA-dependent protein kinase activity
  • protein dimerization activity
  • protein N-terminus binding
  • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity
  • activité kinase
  • protein serine/threonine kinase activity
  • liaison protéique
  • liaison ATP
  • liaison de complexe macromoléculaire
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • DNA repair complex
  • fuseau mitotique
  • nucléoplasme
  • télomère
  • vésicule cytoplasmique
  • noyau
  • nucléole
Processus biologique
  • Somitogenèse
  • response to ionizing radiation
  • neuron apoptotic process
  • reciprocal meiotic recombination
  • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
  • response to hypoxia
  • female gamete generation
  • determination of adult lifespan
  • phosphorylation
  • establishment of protein-containing complex localization to telomere
  • meiotic telomere clustering
  • peptidyl-serine autophosphorylation
  • DNA damage checkpoint signaling
  • regulation of telomerase activity
  • positive regulation of telomerase catalytic core complex assembly
  • positive regulation of telomere maintenance via telomerase
  • positive regulation of neuron death
  • mitotic spindle assembly checkpoint signaling
  • oocyte development
  • lipoprotein catabolic process
  • régulation du cycle cellulaire
  • phosphorylation des protéines
  • développement du cœur
  • développement cérébral
  • positive regulation of neuron apoptotic process
  • negative regulation of telomere capping
  • positive regulation of telomere maintenance via telomere lengthening
  • peptidyl-serine phosphorylation
  • cellular response to gamma radiation
  • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
  • Recombinaison V(D)J
  • positive regulation of apoptotic process
  • regulation of cellular response to heat
  • pre-B cell allelic exclusion
  • cycle cellulaire
  • histone mRNA catabolic process
  • cellular response to nitrosative stress
  • positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
  • double-strand break repair via nonhomologous end joining
  • negative regulation of B cell proliferation
  • transduction de signal
  • establishment of RNA localization to telomere
  • apoptose
  • réplication de l'ADN
  • DNA double-strand break processing
  • regulation of signal transduction by p53 class mediator
  • regulation of autophagy
  • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process
  • cellular response to X-ray
  • double-strand break repair via homologous recombination
  • regulation of apoptotic process
  • negative regulation of TORC1 signaling
  • ovarian follicle development
  • processus du système immunitaire
  • immunoglobulin production
  • DNA damage induced protein phosphorylation
  • male meiotic nuclear division
  • female meiotic nuclear division
  • female gonad development
  • développement postembryonnaire
  • multicellular organism growth
  • protein autophosphorylation
  • thymus development
  • chromosome organization involved in meiotic cell cycle
  • réparation de l'ADN
  • cellular response to DNA damage stimulus
  • regulation of telomere maintenance via telomerase
  • positive regulation of DNA catabolic process
  • regulation of microglial cell activation
  • regulation of cellular response to gamma radiation
  • positive regulation of response to DNA damage stimulus
  • maintien des télomères
  • replicative senescence
  • positive regulation of gene expression
  • positive regulation of cell migration
  • positive regulation of cell adhesion
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • cellular response to retinoic acid
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

472

11920

Ensembl

ENSG00000149311

ENSMUSG00000034218

UniProt

Q13315

Q62388

RefSeq (mRNA)
NM_000051
NM_138292
NM_138293
NM_001351834
NM_001351835

NM_001351836

NM_007499

RefSeq (protéine)

NP_000042
NP_001338763
NP_001338764
NP_001338765
NP_000042.3

NP_031525

Localisation (UCSC)Chr 11: 108.22 – 108.37 MbChr 9: 53.35 – 53.45 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La protéine ATM (en anglais ataxia telangiectasia mutated) est la protéine mutée dans le syndrome d'ataxie télangiectasie. Elle répare les cassures double-brins dans l’ADN occasionnées par des agressions physiques ou des processus physiologiques.

Historique

La première description de patients avec le syndrome d’ataxie-télangiectasie a été publiée en 1926 par Syllaba et Henner[5]. Denise Louis-Bar a également rapporté un cas en 1941 et a donné son nom à la maladie[6]. C’est en 1958 que la nature héréditaire et familiale de la maladie a été évoquée[7]. Le fait que l’ataxie-télangiectasie se transmette de façon autosomique récessive supposait qu’un seul gène était impliqué dans la maladie. L’analyse du génome des patients atteints a permis de localiser un gène impliqué sur le 11e chromosome humain[8]. Ces travaux ont permis d’identifier et de séquencer le gène muté dans l’ataxie-télangiectasie par clonage positionnel en 1995[9].

Du gène à la protéine

Le gène ATM s’étend sur environ 150kb d’ADN génomique sur le locus 11q22-23, contient 66 exons et produit un transcrit épissé de 13kb. ATM fait partie de la super-famille des PI-3-kinases, possédant un domaine catalytique conservé similaire à la PI-3-kinase à son extrémité carboxy-terminale. La différence est qu’ATM est davantage une protéine kinase qu’une lipide kinase, tout comme ATR et DNA-PK qui font partie du même sous-groupe[10]. La protéine ATM possède 3056 acides aminés pour un poids de 350 kD. C’est une sérine thréonine kinase détectable dans tous les tissus, mais plus fortement au niveau de la rate, du thymus, des testicules et des cellules de Purkinje[11]. Son expression est nucléaire chez les fibroblastes, les lymphocytes et les cellules gonadiques tandis qu’elle est plutôt localisée dans le cytoplasme chez les cellules de Purkinje et les cellules endothéliales[12].

Activation d’ATM

La protéine ATM est activée à la suite d'une cassure double-brin dans l’ADN, bien que des signaux ne causant pas de cassure double-brin peuvent également l’activer (UV, oxyde nitrique, privation de nutriments). Lorsque ce type de cassure survient dans l’ADN, le complexe MRN (Mre11/Rad50/Nbs1) est recruté au site d’ADN endommagé et recrute à son tour la protéine ATM. Celle-ci, présente normalement dans la cellule sous forme de dimère inactif, s’auto phosphoryle au niveau de la sérine 1981, entraînant une dédimérisation et une activation d’ATM. Elle phosphoryle ensuite H2AX, une variante de la famille des histones, qui recrute au site d’ADN endommagé plusieurs protéines qui sont subséquemment phosphorylées par ATM, dont 53BP1, BRCA1, Chk1 et Chk2[13],[14],[15],[16],17.

Ces substrats d’ATM vont ensuite induire l’arrêt du cycle cellulaire et l’activation des points de contrôle, deux processus qui vont permettre la réparation de l’ADN endommagé. Si l’ADN est irréparable, des processus d’apoptose ATM-dépendants vont se mettre en branle pour éviter que la cellule survive[17]. Dans les cellules endothéliales et cellules de Purkinje du cervelet, ATM va activer des voies de survies comme celle du NF-kB pour éviter que la cellule entre en apoptose trop rapidement 8[18].

Fonctions

ATM permet de réparer les cassures double-brins dans l’ADN survenant lors d’une agression physique tel des radiations ionisantes via l’activation de deux mécanismes : la recombinaison homologue entre deux molécules sœurs d’ADN et la jonction non homologue des brins brisés (NHEJ) [19],[20]. Ces mécanismes sont induits par l’activation de plusieurs substrats d’ATM : Chk1 et Chk2 activant les points de contrôle du cycle cellulaire, c-Abl activant le processus de recombinaison homologue, BRAC1, qui est impliqué dans la réparation d’ADN et p. 53, un facteur de transcription activant des gènes de réparation d’ADN, d’arrêt du cycle cellulaire et d’apoptose [21],[22].

ATM est impliquée dans la méiose car elle répare les cassures double brin dans l’ADN survenant lors de la recombinaison homologue au cours de la méiose I. Elle agit également dans le maintien et l’auto renouvellement des cellules souches germinales dans les tubules séminifères des testicules[23],[24]. ATM est aussi importante au niveau du système immunitaire car elle répare les cassures double-brins survenant lors de la recombinaison V(D)J. Cette dernière est en fait un réarrangement du génome des lymphocytes B et T immatures qui permet de produire un clone lymphocytaire unique 11, 19.

Au niveau des cellules de Purkinje du cervelet, la protéine ATM aurait un rôle dans la synthèse d’anti-oxydants luttant contre le stress cellulaire et la neurodégénération[25],[26].

Pathologies associées

Une mutation d’un seul allèle dans le gène ATM est un facteur de risque pour le cancer du sein[27], alors qu’une mutation dans les deux allèles entraîne l'ataxie télangiectasie, ou syndrome de Louis-Bar.

L’ataxie télangiectasie est une maladie autosomique récessive avec une incidence d’un cas sur 300,000 naissances[28]. Elle se manifeste par une atteinte neurologique, c’est-à-dire une ataxie cérébelleuse progressive, causée par une dégénérescence des cellules de Purkinje, commençant dès l’âge de deux ans et se manifestant par une mauvaise coordination, des tremblements et troubles d’équilibre. On observe aussi des télangiectasies (éclatement de petits vaisseaux sanguins), une stérilité complète, une radiosensibilité, un déficit immunitaire avec infections respiratoires graves et une susceptibilité accrue aux cancers (#Notes et références|8). Environ 10 à 15 % des personnes atteintes d’ataxie-télangiectasie vont développer un lymphome ou une leucémie avant ou pendant l’adolescence[29].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000149311 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000034218 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Syllaba L., Henner K., Contribution à l'étude de l'indépendance de l'athétose double idiopathique et congénitale. Atteinte familiale, syndrome dystrophique, signe du réseau vasculaire conjonctival, intégrité psychique. Revue neurologique, 1926, 1: 541-560.
  6. Louis-Bar D., Sur un syndrome progressif comprenant des télangiectasies capillaires cutanées et conjonctivales symétriques, à disposition naevoïde et des troubles cérébelleux. Confinia Neurologica, 1941, 4: 32-42.
  7. Boder E., Sedgwick R. P., Ataxia-telangiectasia: a familial syndrome of progressive cerebellar ataxia, oculcutaneous telangiectasia and frequent pulmonary infection. Pediatrics, April 1958, 21(4): 526-554.
  8. Gatti RA et al., localisation of an ataxia-telangiectasia gene on chromosome 11q22-23, Nature. 1988 Dec 8;336(6199):577-80
  9. Savitsky K et al, A single ataxia telangiectasia gene with a product similar to PI-3 kinase, Science. 1995 Jun 23;268(5218):1749-53
  10. McKinnon J, ATM and ataxia telangiectasia, EMBO Rep. 2004 August; 5(8): 772–776
  11. Canman et al, The role of ATM in DNA damage responses and cancer, 1998
  12. Bott et al, Ataxia telangiectasia, a review, Arch. Pediatr. 2006 Mar;13(3):293-8. Epub 2006 Jan 19
  13. vUziel et al, Requirement of the MRN complex for ATM activation by DNA damage, EMBO J. 2003 October 15; 22(20): 5612–5621.
  14. Lee et al, ATM activation by double-strand breaks through the Mre11-Rad50-Nbs1 complex, Science. 2005 Apr 22;308(5721):551-4.
  15. Xu Y, DNA damage : a trigger of innate immunity but a requirement for adaptive immune homeostasis, Nature Reviews Immunology 6, 261-270 (April 2006)
  16. Tanaka et al, ATM activation and histone H2AX phosphorylation as indicators of DNA damage by DNA topoisomerase I inhibitor topotecan and during apoptosis, Cell Prolif. 2006 Feb;39(1):49-60.
  17. Lavin et al, ATM activation and DNA damage response, Cell Cycle. 2007 Apr 15;6(8):931-42.
  18. Yin et al., ATM gene regulates oxygen-glucose deprivation-induced nuclear factor-κB DNA binding activity and downstream apoptotic cascade in mouse cerebrovascular endothelial cells, Stroke 33 (2002), p. 2471–2479.
  19. Van Gent et al., Chromosomal stability and the DNA double-stranded break connection, Nat. Rev. Genet. 2 3 (2001), p. 196–206.
  20. Khanna K.K, and Jackson S.P, DNA double-strand breaks: signaling, repair and the cancer connection, Nat. Genet. 27 3 (2001), p. 247–254.
  21. Barzilai A, Yamamoto K, DNA damage responses to oxidative stress, DNA Repair (Amst). 2004 Aug-Sep;3(8-9):1109-15.
  22. Efeyan A, Serrano M, p. 53 : guardian of the genome and policeman of the oncogenes, Cell Cycle. 2007 May 2;6(9):1006-10.
  23. Rotman G, Shiloh Y, ATM : from gene to function, Hum Mol Genet. 1998;7(10):1555-63.
  24. Takubo K, Hirao A, Ohmura M, Azuma M, Arai F, Nagamatsu G, Suda T, Premeiotic germ cell defect in seminiferous tubules of Atm-null testis, Biochemical and Biophysical Research Communications, 2006 Dec 29;351(4):993-8.
  25. Abraham R.T, Cell cycle checkpoint signaling through the ATM and ATR kinases, Genes Dev. 15 (2001), p. 2177–2196.
  26. Barlow C. et al., Loss of the ataxia-telangiectasia gene product causes oxidative damage in target organs, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96 (1999), p. 9915–9919.
  27. (en) Dumitrescu RG, Cotarla I, « Understanding breast cancer risk, where do we stand in 2005? » J Cell Mol Med. 2005 Jan-Mar;9(1):208-21.
  28. (en) Taylor A.M. et Byrd PJ, « Molecular pathology of ataxia-telangiectasia » J. Clin. Pathol. 58 (2005), p. 1009–1015.
  29. (en) Taylor AM, Metcalfe JA, Thick J, Mak YF, « Leukemia and lymphoma in ataxia telangiectasia » Blood. 1996 Jan 15;87(2):423-38.

Liens externes

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