IRF4

Ne pas confondre avec IrF4, fluorure d'iridium(IV).

IRF4
Structure de la protéine IRF4. Basé sur l'identifiant PDB 2dll.
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2DLL
Identifiants
Aliases	IRF4, Facteur 4 régulateur de l'interferon
IDs externes	OMIM: 601900 MGI: 1096873 HomoloGene: 1842 GeneCards: IRF4
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 6 humain[1] Locus 6p25.3 Début 391,739 bp[1] Fin 411,443 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 13 (souris)[2] Locus 13|13 A3.2 Début 30,933,209 bp[2] Fin 30,950,959 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans ganglion lymphatique endocol appendice iléo-cæcal cellule de la moelle osseuse rate rectum artère temporale superficielle thymus monocyte duodénum Fortement exprimé dans rate sang subcutaneous adipose tissue tissu adipeux brun glande mammaire glande submandibulaire moelle osseuse thymus Cellule de Paneth tissu adipeux blanc Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire sequence-specific DNA binding liaison ADN DNA-binding transcription factor activity DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific transcription factor binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding protein-lysine N-methyltransferase activity liaison protéique DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Composant cellulaire cytosol membrane nucléoplasme noyau Processus biologique regulation of transcription, DNA-templated interferon-gamma-mediated signaling pathway regulation of T-helper cell differentiation myeloid dendritic cell differentiation transcription, DNA-templated T-helper 17 cell lineage commitment régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN peptidyl-lysine methylation negative regulation of toll-like receptor signaling pathway type I interferon signaling pathway histone H3 acetylation histone H4 acetylation positive regulation of DNA binding T cell activation positive regulation of transcription by RNA polymerase II defense response to protozoan protein methylation transcription by RNA polymerase II cytokine-mediated signaling pathway positive regulation of cold-induced thermogenesis processus du système immunitaire Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 3662 16364 Ensembl ENSG00000137265 ENSMUSG00000021356 UniProt Q15306 Q64287 RefSeq (mRNA) NM_001195286 NM_002460 NM_013674 NM_001347508 RefSeq (protéine) NP_001182215 NP_002451 NP_001334437 NP_038702 Localisation (UCSC) Chr 6: 0.39 – 0.41 Mb Chr 13: 30.93 – 30.95 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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IRF4 ou facteur 4 régulateur de l'interferon, est une protéine humaine codée par le gène du même nom et qui appartient au groupe de protéines connues sous le nom des facteurs de régulation de l'interferon.

Description

Le nom est un acronyme formé par les initiales de sa dénomination en anglais (Interferon Regulatory Factor 4). Le gène qui code cette protéine se situe sur le chromosome 6 humain (6p25-p23)^[5],[6]. Dans les mélanocytes, le gène IRF4 pourrait être régulé par MITF^[7]. IRF4 est un facteur de transcription impliqué dans les leucémies^[8]. Des variantes déterminées pour ce gène sont associées à certains traits liés avec la pigmentation de la peau et des poils: sensibilité de la peau lors de l'exposition solaire, vieillissement prématuré de la peau, taches de rousseur, yeux bleus et couleur de cheveux châtain^[9]. Une variante a été impliquée dans l'apparition de cheveux gris^[10].

Cette protéine intéragit avec SPI1^[11],[12].

Notes et références

• (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « IRF4 » (voir la liste des auteurs).

v · m Expression des gènes
Introduction à la génétique	Théorie fondamentale de la biologie moléculaire ADN ARN ARNm Protéine Code génétique Biosynthèse des protéines
Transcription	Régulation de la transcription Facteurs de transcription Facteur trans Facteur cis ARN polymérase Promoteur Amplificateur Inactivateur Activation CRISPR Site d'initiation de la transcription Atténuation transcriptionnelle Régulation post-transcriptionnelle Modifications post-transcriptionnelles Édition Épissage Épissage alternatif Polyadénylation Dégradation des ARNm non-sens Interférence par ARN Micro-ARN
Traduction	Régulation de la traduction Facteurs d'initiation PABP Ribosome ARNt IRES Coiffe Régulation post-traductionnelle Modifications post-traductionnelles (ajout de groupe fonctionnels, peptidiques, modifications structurelles ou chimiques ; par exemple : phosphorylation) Protéolyse
Contrôle épigénétique	Extinction de gène CRISPRoff et CRISPRon Méthylation de l'ADN Code des Histones Gène Hox Gène soumis à empreinte

v · m Voie de signalisation JAK-STAT
Ligand	Cytokine
Récepteurs aux cytokines (en)	Type I cytokine receptor (en) Type II cytokine receptor (en)
Janus kinase	JAK1 JAK2 JAK3 (en) TYK2 (en)
Protéines adaptatrices	STAT STAT1 (en) STAT2 STAT3 STAT4 (en) STAT5 STAT6 PIAS (en) PIAS1 (en) PIAS2 (en) PIAS3 (en) PIAS4 (en) SOCS 1 2 (en) 3 (en) 4 (en) 5 (en) 6 (en) 7 (en) CISH (en) IRF IRF1 (en) IRF2 (en) IRF3 IRF4 IRF5 IRF6 (en) IRF7 (en) IRF8

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