DNMT3A

DNMT3A
Structure de la protéine DNMT3A. Basée sur l'identifiant PDB 2QRV.
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

4U7T, 4QBR, 4U7P, 4QBS, 3A1B, 3LLR, 4QBQ, 3SVM, 3A1A, 2QRV

Identifiants
AliasesDNMT3A
IDs externesOMIM: 602769 MGI: 1261827 HomoloGene: 7294 GeneCards: DNMT3A
Position du gène (Homme)
Chromosome 2 humain
Chr.Chromosome 2 humain[1]
Chromosome 2 humain
Localisation génomique pour DNMT3A
Localisation génomique pour DNMT3A
Locus2p23.3Début25,227,855 bp[1]
Fin25,342,590 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 12 (souris)
Chr.Chromosome 12 (souris)[2]
Chromosome 12 (souris)
Localisation génomique pour DNMT3A
Localisation génomique pour DNMT3A
Locus12|12 A1.1Début3,856,007 bp[2]
Fin3,964,443 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • nerf sural

  • éminence ganglionnaire

  • ovocyte

  • placenta

  • sang

  • stromal cell of endometrium

  • right adrenal gland

  • muscle gastrocnémien

  • muqueuse gastrique

  • left adrenal gland
Fortement exprimé dans
  • male urethra

  • canal éjaculateur

  • epithelium of urethra

  • female urethra

  • medullary collecting duct

  • saccule

  • fosse

  • condyle

  • aorte ascendante

  • cloaque
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • methyltransferase activity
  • activité de transférase
  • liaison ADN
  • DNA-methyltransferase activity
  • liaison de chromatine
  • liaison ion métal
  • liaison protéique
  • identical protein binding
  • DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • transcription corepressor activity
  • transcription factor binding
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • Euchromatine
  • matrice nucléaire
  • nucléoplasme
  • hétérochromatine
  • XY body
  • centromère
  • noyau
Processus biologique
  • response to ionizing radiation
  • regulation of gene expression by genetic imprinting
  • C-5 methylation of cytosine
  • response to estradiol
  • positive regulation of cell death
  • cellular response to ethanol
  • vieillissement
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • DNA methylation involved in gamete generation
  • response to vitamin A
  • méthylation de l'ADN
  • méthylation
  • negative regulation of gene expression, epigenetic
  • response to nutrient levels
  • response to lead ion
  • mise au silence de la chromatine dépendante de la méthylation
  • spermatogenèse
  • différenciation d'un neurone
  • mitose
  • cellular response to amino acid stimulus
  • régulation de l'expression des gènes
  • DNA methylation involved in embryo development
  • response to ethanol
  • réponse à une substance toxique
  • cellular response to hypoxia
  • hepatocyte apoptotic process
  • response to cocaine
  • DNA methylation on cytosine
  • organisation de la chromatine
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

1788

13435

Ensembl

ENSG00000119772

ENSMUSG00000020661

UniProt

Q9Y6K1

O88508

RefSeq (mRNA)
NM_022552
NM_153759
NM_175629
NM_175630
NM_001320892

NM_001320893
NM_001375819

NM_001271753
NM_007872
NM_153743

RefSeq (protéine)
NP_001307821
NP_001307822
NP_072046
NP_715640
NP_783328

NP_783329
NP_001362748

NP_001258682
NP_031898
NP_714965

Localisation (UCSC)Chr 2: 25.23 – 25.34 MbChr 12: 3.86 – 3.96 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

La DNMT3A (pour « DNA methyl-transferase ») est une enzyme dont le gène est le DNMT3A situé le chromosome 2 humain. Elle catalyse le transfert de groupes méthyle vers des structures CpG spécifiques dans l'ADN, un processus appelé méthylation de l'ADN. Cette enzyme est responsable de la méthylation de novo de l'ADN. Cette fonction doit être distinguée de la méthylation d'entretien de l'ADN qui assure la fidélité de la réplication des modèles épigénétiques hérités alors que la méthylation de novo de l'ADN modifie les informations transmises par le parent à la descendance. Elle permet des modifications épigénétiques essentielles pour des processus tels que la différenciation cellulaire et le développement embryonnaire, la régulation transcriptionnelle, la formation d'hétérochromatine ainsi que la stabilité du génome[5].

Gène

La DNMT3A est une protéine de 130 kDa codée par 23 exons présents sur le chromosome 2 chez l'homme[6]. Il existe une homologie de 98 % entre les homologues humains et murinae[7].

En raison de l'épissage, il existe deux principales isoformes d'ARN chez les rongeurs, Dnmt3a1 et Dnmt3a2. Ces isoformes existent dans différents types de cellules[8].

Rôles

Elle intervient dans la différenciation cellulaire, notamment dans l'hématopoïèse[9].

Médecine

Des mutations de son gène sont décrites dans plusieurs leucémies dont la leucémie aiguë myéloblastique[10], entraînant une importante diminution de la fonction de la protéine DNMT3A.

Voir aussi

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000119772 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020661 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. (en) Yuanhui Jia, Pishun Li, Lan Fang et Haijun Zhu, « Negative regulation of DNMT3A de novo DNA methylation by frequently overexpressed UHRF family proteins as a mechanism for widespread DNA hypomethylation in cancer », Cell Discovery, vol. 2, no 1,‎ , p. 1–20 (ISSN 2056-5968, DOI 10.1038/celldisc.2016.7, lire en ligne, consulté le )
  6. K. D. Robertson, E. Uzvolgyi, G. Liang et C. Talmadge, « The human DNA methyltransferases (DNMTs) 1, 3a and 3b: coordinate mRNA expression in normal tissues and overexpression in tumors », Nucleic Acids Research, vol. 27, no 11,‎ , p. 2291–2298 (ISSN 0305-1048, PMID 10325416, DOI 10.1093/nar/27.11.2291, lire en ligne, consulté le )
  7. S. Xie, Z. Wang, M. Okano et M. Nogami, « Cloning, expression and chromosome locations of the human DNMT3 gene family », Gene, vol. 236, no 1,‎ , p. 87–95 (ISSN 0378-1119, PMID 10433969, DOI 10.1016/s0378-1119(99)00252-8, lire en ligne, consulté le )
  8. Liubin Yang, Rachel Rau et Margaret A. Goodell, « DNMT3A in haematological malignancies », Nature Reviews. Cancer, vol. 15, no 3,‎ , p. 152–165 (ISSN 1474-1768, PMID 25693834, PMCID 5814392, DOI 10.1038/nrc3895, lire en ligne, consulté le )
  9. Challen GA, Sun D, Jeong M et al. Dnmt3a is essential for hematopoietic stem cell differentiation, Nat Genet, 2012;44:23–31
  10. Yang L, Rau R, Goodell MA, DNMT3A in haematological malignancies, Nat Rev Cancer, 2015;15:152–165


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